A Região do Algarve conta com uma rede pública de cuidados primários, constituída por 3 Agrupamentos de Centros de Saúde (ACES): ACES Algarve I - Central; ACES Algarve II - Barlavento, e ACES Algarve III - Sotavento, que englobam os 16 Centros de Saúde (CS), 68 Extensões de Saúde, Unidades de Saúde Familiar (USF) e restantes Unidades Funcionais, e que oferecem assistência integral e integrada ao longo do ciclo de vida através da prestação de cuidados de medicina geral e familiar e de enfermagem, quer em ambulatório quer no domicílio, e ainda serviços de saúde pública em múltiplas áreas.
Os Agrupamentos de Centros de Saúde, através das respectivas Unidades Funcionais, apoiam e participam em projectos comunitários, em programas de promoção da saúde em meio escolar e dispõem ainda de serviços, como preparação para o parto e pós-parto, apoio social, aconselhamento alimentar e nutricional e consultas de especialidades por indicação do médico de família.
Encontram-se em atividade 10 Unidades de Saúde Familiar (USF) integradas nos três Agrupamentos de Centros de Saúde do Algarve: USF Âncora (Olhão, 2006), USF Al-Gharb (Faro, 2007), USF Balsa (Tavira, 2007), USF Mirante (Olhão, 2008), USF Monchique (Monchique, 2008), USF Farol (Faro, 2009), USF Albufeira (Albufeira, 2009), USF Guadiana (Vila Real de Santo António/Castro Marim, 2009) USF Ria Formosa (Faro, 2010), USF Lauroé (Loulé, 2011).
Encontram-se em atividade 11 Unidades de Cuidados na Comunidade (UCC), integradas nos três Agrupamentos de Centros de Saúde do Algarve: a UCC de Faro, a UCC Infante em Lagos, a UCC Sto António de Arenilha em Vila Real de Sto António, a UCC Olhar + em Olhão, a UCC Alportellus em São Brás de Alportel, a UCC Talabriga em Tavira, a UCC Dunas em Portimão, a UCC Rio Arade em Silves, a UCC Gentes de Loulé, a UCC Al-Buhera em Albufeira e, a UCC D'Alagoa em Lagoa.
A rede pública de cuidados hospitalares do Algarve conta com dois Hospitais do Sector Empresarial do Estado (EPE), o Hospital de Faro, EPE , e o Centro Hospitalar do Barlavento Algarvio, EPE (que integrou o Hospital do Barlavento Algarvio e o Hospital de Lagos), dispondo ambos de 789 camas. Ambas as unidades hospitalares, dispõem de consulta, internamento, hospital de dia, hemodiálise e maternidade, para além de serviços de reabilitação e apoio ao diagnóstico. Estão integrados nas redes nacionais de referenciação hospitalar, dispondo de Serviços de Urgência para adultos, crianças e recém-nascidos, Unidade de Acidente Vascular Cerebral (AVC), integrada na Via Verde do AVC, e Unidade de Enfarte Agudo do Miocárdio (EAM), integrada na Via Verde do EAM.
Em 2006 entrou em funcionamento, em regime de parceria público/privado, uma nova unidade de saúde – Centro de Medicina de Reabilitação do Sul (CMRSul) – com uma lotação de internamento de 54 camas em São Brás de Alportel, vocacionada para o tratamento e recuperação das consequências motoras de acidentes, lesões medulares, traumatismos crâneo-encefálicos, acidentes vasculares cerebrais e outras patologias do foro neurológico, reumatológico, ortopédico, cardiovascular e pneumológico.
